一:项目名称:16S rDNA测序
二:实验原理:细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数可分为3种,分别为5S、16S以及23S rRNA。16S rRNA为核糖体RNA的一个亚基,16S rDNA即编码该亚基的基因。16S rDNA序列包含10个保守区域和9个可变区域,保守区在细菌间差异不大,高变区具有属或种的特异性。对V4可变区进行测序,可对环境(如土壤、水源、皮肤、肠道等)的微生物多样性进行分析。获得的物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等信息对环境中微生物组成及进化、微生态研究有重要指导作用。
三:部分实验结果展示
各水平物种组成柱状图(节选)
基于Krona的分类学组成交互网页
物种聚类组成热图(节选)
带分组丰度饼图的优势物种子网络图